2014年由云舟生物自主研发的VectorBuilder(载体家)平台上线,颠覆了传统低效的载体制备方式,首度实现了载体构建的智能化、自动化和商业化运作。通过VectorBuilder平台,用户可以轻松快捷地设计及购买个性化载体,极大地提升了科研效率。
随着生物、医学等领域研究课题的深度和复杂度不断提高,科研界对真正高效、便捷、易用的载体编辑工具的需求也日益凸显。基于在载体设计、编辑领域长达十年的专业积累,及VectorBuilder平台所取得的成功实践,云舟生物再度发力,推出一款全新的、综合性更强、更直观的载体编辑软件——VectorBee,旨在为全球科研工作者提供更为直观便捷且更加适应个性化设计需求的载体编辑体验。
(VectorBee)
VectorBee由一群资深生物科学家和IT专家联合打造,秉持“全程可视化”的设计理念,涵盖从载体设计、编辑到分析的每一个环节。这款软件凝聚了众多开发人员的的智慧和汗水,希望在功能和体验上都能充分满足实际的科研需要。
VectorBee拥有设计、编辑、分析和展示四大板块的功能。
自主个性化设计(Design)
■ 支持新建及多种方式导入序列文件:可通过Vector ID直接导入在VectorBuilder线上设计平台中设计的载体,也可在popular vectors列表中导入常用载体,还可从popular components数据库中选择元件插入;自动识别序列,可自动识别序列元件,可导入及识别NCBI基因序列;
■ 便捷项目管理:可在一个文件中添加多个载体项目,可通过Project Dashboard面板进行项目管理。
(项目界面)
多样化个性化编辑(Edit)
■ 序列编辑:可进行序列的增加/删除/查找/替换等操作;
■ 元件编辑:元件的插入/标记/替换/信息编辑/展示;
■ 酶切位点编辑:酶切位点的选择性展示/样式标记/替换;
■ 翻译序列编辑:翻译序列(Translation and CDS)的标记/展示/氨基酸突变;
■ 引物编辑:引物的标记/展示;
■ 其他:载体的多种视图展示/信息编辑。
(编辑菜单)
精准全方位分析(Analyze)
■ 酶切位点分析:快速查看载体的酶切位点分布情况;
■ 翻译序列分析:可查看载体的理论翻译情况;
■ 分析工具集成:Tools功能菜单拥有多种序列分析工具。
(翻译序列)
(Tools菜单)
多样化多形式展示(Visualize)
■ 多种载体展示形式:环状图谱/线形图谱/序列图谱;
■ 多种可展示标记:元件/酶切位点/翻译序列/引物/载体信息;
■ 多种碱基展示样式:字体颜色标记/背景色标记/大小写切换/碱基四色或双色展示等(View 板块)。
(酶切位点可视图)
2024年正值云舟生物十周年的里程碑时刻,为感谢用户和支持者们的信任与支持,VectorBee将向全球科研工作者免费开放。这不仅是我们一贯秉承的开放共赢理念的有力实践,更是云舟生物立志推动科研进步和社会发展的宏伟愿景的具体体现。
当前,VectorBee测试版已初步实现多项核心功能,基本满足了大部分用户的载体编辑需求,尽管如此,研发团队仍希望收集更多用户及各行业科研工作者的使用感受和反馈,以不断完善确保正式版能满足每一位用户的深度需求。
目前,研发团队正在全力打磨及实现以下功能:
1、Windows、Mac、Linux/Ubuntu系统跨平台兼容(目前已推出Windows测试版);
2、包括测序峰图在内的多序列比对;
3、提供进阶的引物设计功能;
4、直接导入NCBI基因。
VectorBee的诞生,是云舟生物在载体编辑工具领域的一次崭新探索,同时也是对云舟现有产品和服务体系的重要补充。
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