《内部控制规范》中最重要的内容是单位层面建设和业务层面建设。业务层面好理解，就是预算、收支等六大经济业务，单位层面是什么意思？具体包括哪些内容？有的单位望文生义，认为业务层面是六大业务，那么单位层面有“单位”这两个字，就是指单位的所有业务，所以就认为党建、考勤、安全、卫生等等都属于内部控制的范围，这种理解显然是错误的。
单位层面是指内部控制的控制环境，为业务层面的建立和实施提供基础性的保障，如果说业务层面是花，那单位层面就是土，业务层面的流程制度搞得再好，领导不支持不推动，其他部门因为职责不清晰对内控建设不配合不作为，那么最终业务层面的内部控制必将是失败。
《内部控制规范》中涉及单位层面的内容有六条（第十三条—第十八条），涵盖了五个方面的内容：内部控制组织管理、决策机制、关键岗位管理、会计体系和信息系统。单位内控建设首先要做的就是建立内部控制的组织架构，分事行权、分岗设权，明确职责。决策机制是指重大事项内部决策要遵循的原则要求和方法，主要内容包括决策、执行和监督是如何分离的，单位党组织对“三重一大”事项如何集体决策的，行政工作事项是如何决策的等等。党、政领导班子实施决策以后，由主责部门和岗位人员来具体执行，在这里提出了“关键岗位”的概念，根据内部控制全面性原则的要求，内部控制应纵向到边、横向到底，全体工作人员都应该参与，但是按照二八原则，重点要抓关键岗位，对关键岗位的管理主要包括建立健全责任制，不相容岗位必须要分离，定期轮岗等等，还有就是要对关键岗位人员进行教育培训。会计体系包括会计机构和会计核算，会计机构依据“三定”规定文件设置，会计核算必须严格执行国家统一的会计制度，除了2019年开始施行的政府会计制度，行政单位有行政单位财务规则，事业单位有事业单位财务规则，单位会计核算必须要遵循所有涉及到的法规文件。信息系统是指信息化管理软件，单位层面、业务层面的流程制度将来都必须要固化到计算机程序中，实现由“人控”到“机控”的转变。
《内部控制规范》第十二条是内部控制的八大控制方法，这一部分与其说是风险管控的措施和程序，不如说是内部控制的工作机制，是设计编写内部控制制度文件的原则和方法，也应该属于单位层面建设的内容。
单位层面建设需不需要画流程图？设计编写制度文件？《内部控制规范》没有提出这个要求，每年度财政部《内部控制报告》也没有提出提供单位层面流程制度佐证材料的要求。我们认为，与业务层面一样，单位层面涉及到的决策、关键岗位管理、信息公开、会计核算等管理活动应该建立相应的流程和制度文件，比如《“三重一大”事项集体决策实施办法》、《局党组会议事规则》、《局长办公会议事规则》、《干部职工教育培训管理办法》、《关键岗位轮岗和工作补位管理办法》等等。事实上，这也很好多单位制度建设的薄弱环节。
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